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Inserción de todo el genoma entre dos especies homólogas de roble asiático

Inserción de todo el genoma entre dos especies homólogas de roble asiático

Bosques mixtos de robles en la Reserva Natural de Hohe, provincia de Hubei (izquierda); Un estudiante de doctorado recolecta muestras de un roble antiguo (derecha) en la Reserva Natural de Guanshan, provincia de Jiangxi (derecha). Crédito: Universidad de Zhejiang

El género Quercus, comúnmente conocido como el roble, es uno de los más exitosos evolutivamente en el hemisferio norte en términos de diversidad de especies, biomasa y rango de distribución. Los robles generalmente pueden vivir hasta unos pocos cientos de años, y durante su larga vida muestran una alta tolerancia a diversas amenazas bióticas y abióticas. Mientras tanto, los robles son bien conocidos por su amplio flujo de genes interespecíficos, que se cree que es beneficioso en su amplia difusión. Estos rasgos hacen de Quercus una especie ideal para el estudio de la introversión adaptativa.

Recientemente, el equipo de investigación dirigido por el profesor Chen Jun de la Facultad de Ciencias de la Vida de la Universidad de Zhejiang publicó un artículo titulado “Análisis de la interferencia de todo el genoma entre dos robles asiáticos simpáticos”. Océano” en El medio ambiente y la evolución de la naturaleza.. Su investigación se centró en dos especies de roble asiático que son similares en amplios rangos de distribución, Quercus acutissima y Q. variabili, para explorar cómo la introgresión puede ayudar en la rápida adaptación a diferentes condiciones ambientales.

En este estudio, Ph.D. Los estudiantes recolectaron muestras en 15 provincias de China y generaron un ensamblaje del genoma completo de cromosomas de alta calidad, secuenciación del genoma de la población y datos transcriptómicos para investigar la asociación entre los patrones de introgresión, la tasa de recombinación, las variaciones genéticas de adaptación local y la regulación de la expresión génica.

Inserción de todo el genoma entre dos especies homólogas de roble asiático

Relación entre las distribuciones de entrada genética y los cambios relacionados con el medio ambiente y las tasas de recombinación. Crédito: Universidad de Zhejiang

Las regiones desarrolladas se encuentran en todo el genoma y están determinadas principalmente por la variación genética y las condiciones ambientales. Cuanto más similar sea su entorno, más probable es que las dos especies de roble se intercambien en las mismas regiones genómicas. Las mutaciones adaptativas progresivas fueron mantenidas por seleccion natural en cuatro extensiones cromosómicas largas debido a la tasa de recombinación suprimida, que puede deberse a inversiones cromosómicas resultantes de la introducción de elementos transponibles. La mayoría de las mutaciones progresivas adaptativas estaban presentes en elementos cis formados por inserciones de TE y niveles de expresión génica alterados en respuesta a estímulos ambientales. En resumen, parecido Condiciones ambientales Condujo a un intercambio genético similar ya características expresivas similares entre los robles.

Este estudio proporciona nuevos conocimientos sobre los mecanismos genéticos de introducción y adaptación ambiental en especies simpátricas.


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más información:
Ruirui Fu et al, Análisis de todo el genoma de la introducción entre dos especies de robles asiáticos homocigóticos, El medio ambiente y la evolución de la naturaleza. (2022). DOI: 10.1038 / s41559-022-01754-7

Proporcionado por la Universidad de Zhejiang

La frase: Recuperación de todo el genoma entre dos especies de robles asiáticos homocigóticos (2022, 14 de junio) 14 de junio de 2022 de https://phys.org/news/2022-06-genome-wide-introgression-sympatric-asian-oak.html

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