febrero 3, 2023

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Los investigadores encontraron duplicaciones de genes repetidas y diversidad genética en la proteína quinasa R en murciélagos con orejas de ratón.

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A ) sitios bajo selección positiva en la proteína quinasa R de mamíferos (PKR). Los paneles gráficos representan probabilidades posteriores de selección positiva [Bayes empirical Bayes (BEB)] ( y ) en la forma M2 (ω > 1) para cada codón (eje X ). Las barras rojas indican sitios con un BEB >0,95. Los números entre paréntesis son el total de especies analizadas. Antivirales: el virus del herpes US11, el virus de la influenza A (IAV) NS1A, el virus de la viruela E3 y K3 (recuadros con rayas verdes), el virus de la hepatitis C (HCV) NS5A y el VIH Tat, se ha informado que todos interactúan directamente con PKR. ( B (máxima probabilidad de que un linaje PKR de murciélago denote vástagos que se sometan a selección positiva) PAGS <0,05, en rojo). Corchetes, valores estimados de ω y la proporción de sitios sujetos a selección positiva. Barra de escala, número de sustituciones por sitio. ( C ) máxima probabilidad de que las cepas evolucionen a partir de miotis Copias paralelas de PKR, con murina aurata , E. fuscus Y el Lasiurus borealis Y el Pipistrellus kuhlii Como grupos externos (doblados para visualización). PKR1L y PKR2L pueden ser variantes similares o variantes de empalme de PKR1 y PKR2, respectivamente. Los colores indican PKR duplicados aislados de un solo individuo. Se muestran valores de arranque de ≥0.7. Barra de escala, número de sustituciones por sitio. ( D ) la posición canónica de FEI2 A K2 / PKR en mamíferos. Los genes se muestran EIF2AK2 (flechas negras y grises) y pseudogen EIF2AK2 (flecha de contorno) y genes vecinos (flechas blancas). Se indican las coordenadas del genoma. ( mi ) Patrón de expresión de los isotipos de PKR tras el tratamiento basal y con IFNα M. Feeliver fibroso. Los diagramas de caja representan el número de lecturas en una escala logarítmica 10 para cada caso y el transcrito de PKR (para exones localizados en ambos genes). crédito: Avances de la ciencia (2022). DOI: 10.1126 / sciadv.add7540″ ancho=»800″ altura=»500″/>

PKR ha sido el objetivo de una fuerte diversificación para la selección positiva y la duplicación nativa en murciélagos. (a) Sitios bajo selección positiva en la proteína quinasa R de mamíferos (PKR). Los paneles gráficos representan probabilidades posteriores de selección positiva [Bayes empirical Bayes (BEB)] (y eje) en la forma M2 (ω > 1) para cada codón (X Eje). Las barras rojas indican sitios con un BEB >0,95. Los números entre paréntesis son el total de especies analizadas. Antivirales: el virus del herpes US11, el virus de la influenza A (IAV) NS1A, el virus de la viruela E3 y K3 (recuadros con rayas verdes), el virus de la hepatitis C (HCV) NS5A y el VIH Tat, se ha informado que todos interactúan directamente con PKR. (B(Probabilidad filogenética máxima de PKR de murciélago que denota vástagos sujetos a selección positiva)s c) el máximo potencial de desarrollo de histoplasmosis meotis Transcripción de PKR parálogo, con Morena UrataY el E. fuscusY el Lasiurus borealisY el Pipistrellus kuhlii como grupos externos (contraídos para visualización). PKR1L y PKR2L pueden ser variantes similares o variantes de empalme de PKR1 y PKR2, respectivamente. Los colores indican PKR duplicados aislados de un solo individuo. Se muestran valores de arranque de ≥0.7. Barra de escala, número de sustituciones por sitio. (Dr) posición canónica FEI2aK2/ PKR en mamíferos. los EIF2AK2 genes (flechas negras y grises), el EIF2AK2 Se muestran el pseudogen (flecha de contorno) y los genes adyacentes (flechas blancas). Se indican las coordenadas del genoma. (mi) Patrón de expresión de los isotipos de PKR tras el tratamiento basal y con IFNα METRO fibroso. Los diagramas de caja representan el número de lecturas en el registro10 Una medida de cada condición y transcripción de PKR (para exones ubicados en ambos genes). se le atribuye: Avances de la ciencia (2022). DOI: 10.1126/sciadv.add7540

Un equipo internacional de investigadores ha encontrado evidencia de una mayor replicación del genoma y diversificación genética en la proteína quinasa R (PKR) en murciélagos con orejas de ratón. En su artículo publicado en la revista Avances de la cienciaEl grupo describe su estudio de la genómica de múltiples especies de murciélagos orejudo y la secuenciación de 15 de ellos.


Investigaciones anteriores han demostrado que los murciélagos pueden albergar muchas infecciones virales que no les hacen daño – es una de las razones por las que han sido acusados ​​como portadores de virus que pasan a otros animales y/o humanos. En este nuevo esfuerzo, los investigadores buscaron aprender más sobre por qué los murciélagos no pueden permanecer ilesos cuando se infectan con virus que dañan a la mayoría de los otros mamíferos.

El trabajo del equipo se centró principalmente en la proteína PKR, una proteína codificada por el gen EIF2AK2. Investigaciones anteriores han demostrado que es una parte importante de las respuestas inmunitarias a los virus en los mamíferos. Obtenga más información sobre cómo funciona al bate en comparación con otros MamíferosLos investigadores observaron Secuencia de genes de 33 especies de murciélagos orejudo.

Se centraron particularmente en las diferencias en EIF2AK2, que conducen a diferencias en PKR, que a su vez explican las diferentes capacidades antivirales. El equipo también secuenció los genomas de 15 especies para obtener una mayor perspectiva sobre el papel que desempeñó EIF2AK2 en la historia del murciélago orejudo.

Los investigadores encontraron evidencia de lo que describen como carrera de armamentos entre EIF2AK2 y varios virus. Y como parte de esta carrera armamentista, surgieron iteraciones en algún momento. EIF2AK2 comenzó a aparecer dos veces en el genoma, lo que permitió que se generaran dos tipos diferentes de PKR en cada murciélago que estudiaron. Y las dos copias no solo se duplicaron en matar virus; Eran ligeramente diferentes, lo que permitió que el murciélago que los albergaba luchara contra el virus de dos maneras. Los investigadores sugieren que esta es probablemente la razón por la cual los murciélagos pueden albergar virus sin enfermarse.

Los investigadores también encontraron algunas especies que tenían más de dos copias de EIF2AK2 y, en algunos casos, otros genes que eran muy similares a EIF2AK2. De cualquier manera, es probable que haga que los murciélagos sean más aptos para el combate. virus. También señalan que tal duplicación hasta ahora solo se ha encontrado en murciélagos.

más información:
Stéphanie Jacquet et al, La duplicación adaptativa y la diversificación genética de la proteína quinasa R contribuyen a la especificidad de las interacciones entre virus de murciélagos, Avances de la ciencia (2022). DOI: 10.1126/sciadv.add7540

© 2022 Ciencia X Red

La frase: Los investigadores encuentran duplicaciones de genes frecuentes y diversificación genética en la proteína quinasa R en murciélagos con orejas de ratón (25 de noviembre de 2022), consultado el 25 de noviembre de 2022 en https://phys.org/news/2022-11-gene-duplications-genetic -diversificación -proteína.html

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