Un patógeno que causa infección del tracto respiratorio superior (URTI) e infección del tracto respiratorio inferior (LRTI) en adultos y niños es el metapneumovirus humano (HMPV). recién diario de infecciones Un estudio que explora la diversidad genética, la prevalencia y la dinámica evolutiva del HMPV.

estancia: Aparición, impacto y evolución de las variantes del metapneumovirus humano de 2014 a 2021 en España. Crédito de la imagen: VO IMÁGENES / Shutterstock.com

fondo

HMPV pertenece a neumococo familia y causa síntomas similares al virus sincitial respiratorio humano (HRSV). El HMPV es un virus de ácido ribonucleico (ARN) con envoltura, lineal y de sentido negativo que se puede clasificar en los genotipos HMPV-A y HMPV-B, con subgenotipos que incluyen A1, A2 (linajes A2a, A2b, A2c) y B1 y B2 ( cepas B2a y B2b).

El genoma de HMPV consta de ocho genes que codifican nueve proteínas. El esquema en el que se codifican las proteínas es 3′-NPMF-M2 (M2–1/M2–2) – SH-GL-5′.

Recientemente, en el dominio externo de la glicoproteína (G) unida, múltiples de los nucleótidos 180 y 111 se han asociado con LRTI y evasión inmune en la edad adulta.

sobre estudiar

El presente estudio tiene como objetivo caracterizar la dinámica evolutiva y la diversidad genética del HMPV en pacientes adultos y pediátricos de un hospital universitario de Barcelona en las temporadas comprendidas entre 2014-2015 y 2020-2021.

El HMPV confirmado por laboratorio se caracterizó en función de la secuencia del gen G codificante parcial. Para el ensamblaje de las secuencias de nucleótidos se utilizó MEGA.v6.0.

Los árboles filogenéticos se construyeron con base en las puntuaciones más bajas del criterio de información bayesiano. Estos árboles se evaluaron utilizando 1000 remuestreos de arranque. La secuenciación del genoma completo (WGS) se realizó con Illumina y los análisis filogenéticos con Nextstrain y Datamonkey.

Hallazgos principales

De acuerdo con otros estudios, la prevalencia de HMPV en los años previos a la pandemia fue similar, con un patrón estacional anual y un pico claro. Sin embargo, la aparición de la pandemia del Coronavirus 2019 (COVID-19) ha interrumpido la circulación de HMPV. Desde el verano de 2020 circulan virus envueltos; Sin embargo, ni HRSV ni HMPV fueron dominantes.

En el verano de 2021, la propagación del VIH (HMPV) y el virus de la inmunodeficiencia humana (HRSV) estalló nuevamente y provocó dos picos epidémicos, el segundo de los cuales comenzó en el otoño. Esto puede deberse a la falta de intervención viral en ese momento o a la flexibilización de las medidas preventivas por parte de los españoles. Durante el segundo pico, la prevalencia de HMPV fue mayor en comparación con temporadas anteriores, probablemente porque dos generaciones aún no estuvieron expuestas a la infección inicial.

Las co-detecciones más comunes fueron adenovirus, rinovirus, bocavirus y enterovirus. La tasa de detección conjunta aumentó después de la pandemia de COVID-19 y se observó un cambio en la mayoría de los virus detectados conjuntamente.

El HMPV mostró una mayor incidencia entre los niños menores de dos años en temporadas previas a la pandemia; Sin embargo, esto cambió durante la pandemia. También hubo una mayor tendencia a que los niños varones se vieran afectados. En contraste, en la población adulta, las mujeres y las personas de 50 años o más tenían mayor riesgo.

Se observó un patrón de cambios cíclicos de dominancia con respecto a la circulación de HMPV-A. Además, se ha observado una mayor prevalencia de virus A2c portadores de múltiplos, con A2c_180dup Descrito primero, seguido de A2c_111dup. dominancia A2c_111dup Indica que la repetición de 180 nucleótidos cubre una gran cantidad de proteína F, lo que puede afectar la fusión de la membrana y prevenir la replicación viral.

De acuerdo con la mayor prevalencia y dominio de las variantes A2c durante la pandemia de COVID-19, también se ha descrito una mayor morbilidad de la infección por HMPV al final de la pandemia de influenza A(H1N1)pdm09. En ese momento, A2c mostró una distancia genética media más alta y propiedades inmunoevasivas que contribuyeron a su dominio agresivo.

conclusiones

El HMPV afectó tanto a niños como a adultos y mostró una morbilidad significativa durante todo el período de estudio. La epidemia de HMPV se vio interrumpida por la pandemia de COVID-19 en 2020, lo que resultó en dos picos inesperados más tarde en el verano y el otoño de 2021.

WGS mostró una alta conservación de la proteína F y una rica diversidad de proteína G, lo que indica la necesidad de protección estérica de G sobre F. El estudio actual es un ejemplo efectivo de vigilancia virológica para un virus respiratorio que no sea HRSV o influenza. Proporciona información importante sobre la evolución en tiempo real de HMPV y su impacto en la salud pública.