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Publicación anticipada: Burkholderia thailandensis aislada de una herida infectada, suroeste de China, 2022 – Volumen 30, Número 5 – Mayo de 2024 – Journal of Emerging Infectious Diseases

Descargo de responsabilidad: los artículos de lanzamiento anticipado no se consideran lanzamientos finales. Cualquier cambio se reflejará en la versión en línea en el mes en que se publique oficialmente el artículo.


Afiliaciones de autor: Hospital Dazu afiliado a la Universidad Médica de Chongqing, Chongqing, China (J. Li); Hospital Daping de la Universidad Médica Militar, Chongqing (J. Li, Q. Zhong, W. Lu); Hospital General del Comando del Teatro Occidental, Chengdu, China (J. Tan); Hospital Popular del Condado de Dazhou, Dazhou, Sichuan, China (X. Xiong)

Burkholderia Tailandia El es miembro de Pseudotumor de Burkholderia complejo y generalmente considerado no patógeno (1). Identificado inicialmente en Tailandia, B. thailandensis Destacado de B. Mentiroso A través de su capacidad para asimilar arabinosa (2). es parecido a B. Mentiroso, B. thailandensis Se encuentra abundantemente en el suelo y el agua, especialmente en los arrozales (3,4). Aunque las infecciones invasivas causadas por B. thailandensis Son poco comunes en todo el mundo y en informes recientes se han documentado casos de infecciones supurativas, como infecciones de heridas, celulitis y abscesos tisulares.5,6). Anteriormente identificamos la cepa de B. thailandensis BPM que causó infección humana en Chongqing, suroeste de China (7). En este estudio otro aislado clínico de L B. thailandensis Que obtuvimos en Dazhou, Sichuan, suroeste de China, de una herida infectada resultante de una herida infligida por un implemento agrícola en 2022.

Un granjero de 61 años que tenía diabetes tipo 2 no tratada informó un historial de dolor e hinchazón de 1 mes en la rodilla izquierda. Hace un mes se había lastimado el dedo medio del pie izquierdo con un arado y tenía enrojecimiento, hinchazón y dolor debajo de la articulación de la rodilla izquierda. A pesar de una semana de tratamiento antimicrobiano en un centro de salud comunitario local, sus síntomas no mejoraron. En diciembre de 2022, el paciente comenzó a sentir debilidad en su extremidad inferior derecha, para posteriormente caer debido a una lesión en su extremidad inferior izquierda. Durante este período, experimentó debilidad en las extremidades inferiores y desarrolló síntomas relacionados con el sistema nervioso central. Buscó atención y fue ingresado en el Departamento de Ortopedia del Hospital Popular Provincial de Dazhou (Dazhou, China) para recibir tratamiento por una lesión en la extremidad inferior izquierda y una infección en el pie izquierdo debido a la diabetes. Sin embargo, cuando los síntomas de su sistema nervioso central empeoraron, lo trasladaron al departamento de neurología y le diagnosticaron osteomielitis y enfermedad desmielinizante. B. thailandensis La cepa 2022DZh se obtuvo de una muestra de tejido profundo durante el desbridamiento quirúrgico de la herida infectada en el pie izquierdo (Supl. Fig. 1). La terapia antimicrobiana empírica consiste en cefradina. Sin embargo, el laboratorio del hospital analizó el aislado 2022DZh utilizando el sistema VITEK 2 COMPACT (bioMérieux, https://www.biomerieux.com) y lo especificó B. MentirosoLo que lleva a un cambio a la terapia con meropenem intravenoso (Tabla 1 del Apéndice). A pesar del tratamiento con meropenem, el estado del paciente continuó deteriorándose; Falleció 3 días después de presentar la solicitud de alta.

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Posteriormente, el aislado 2022DZh fue enviado al laboratorio para verificación de su identidad. Resultados de la prueba de asimilación de arabinosa para el aislado 2022DZh mediante el sistema API 20NE (bioMérieux, https://www.biomerieux.com) fueron positivos, consistentes con las características bioquímicas de B. thailandensis (Apéndice Figura 2). Extrajimos ADN del aislado 2022DZh para confirmación y caracterización adicional. Realizamos la secuenciación del gen 16S rRNA de 2022DZh utilizando el nucleótido BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi), revelando un 100% de similitud con B. thailandensis BPM (Figura 3 del Suplemento). Las secuencias de nucleótidos de los dos cromosomas del aislado 2022DZh coinciden en más del 99,5% con las de B. thailandensis E264 y B. thailandensis E254 (Apéndice Tabla 2). Hemos identificado de manera concluyente el aislado 2022DZh como B. thailandensis Basado en nuestros datos fenotípicos y moleculares. Hemos depositado la secuencia del genoma de B. thailandensis cepa 2022DZh en GenBank (números de registro CP141809.1 y CP141811.1).

apariencia

Árbol filogenético de copia única y análisis de identidad de nucleótidos promedio de genomas de Burkholderia thailandensis 2022DZh de un paciente en Dazhu, Sichuan, China, y otros aislados de especies de Burkholderia.  A) Árbol filogenético de copia única construido utilizando los genomas de B. thailandensis 2022DZh y otros 25 aislados de diferentes especies de Burkholderia.  B) Se desarrolló un mapa térmico de identidad de nucleótidos promedio utilizando los genomas de B. thailandensis 2022DZh y otros 9 aislados de diferentes especies de Burkholderia.

apariencia. Análisis de árbol filogenético de copia única e identidad promedio de nucleótidos de dos genomas Burkholderia Tailandia 2022DZh de un paciente en Dazhou, Sichuan, China, y otros aislados de…

Para el análisis filogenético, comparamos los genomas. B. thailandensis 2022DZh con placa de referencia disponible públicamente Burkholderia Genomas de especies (Tabla complementaria 3). El análisis del árbol filogenético de copia única indicó esto B. thailandensis Conjuntos 2022DZh con B. thailandensis BPM (Figura, panel A). Los resultados promedio de identidad de nucleótidos mostraron esto B. thailandensis 2022DZh también se agrupa con B. thailandensis Por qué; La identidad del genoma fue del 99,85%. Sin embargo, en comparación con B. Mentiroso BPC006, la identidad del genoma fue del 92,31 % (Figura, Panel B), lo que coincide con el umbral del 95 % comúnmente utilizado para distinguir especies. Mediante análisis de tipo de secuencia multilocus (https://pubmlst.org/organisms/burkholderia-pseudomallei) (8), así lo decidimos B. thailandensis 2022DZh y B. thailandensis Ambos pertenecen al tipo de secuencia 76. Además, no parece existir ningún vínculo epidemiológico conocido entre ellos. B. thailandensis 2022DZh y B. thailandensis Por qué; Están separados geográficamente por una gran distancia de ≈200 km (Apéndice Tabla 3).

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Una limitación de este estudio es que no intentamos identificar aislados relacionados B. thailandensis De muestras ambientales en esta región del suroeste de China. Se necesitan más estudios para determinar los mecanismos moleculares primarios que subyacen a la patogénesis de la enfermedad. B. thailandensis 2022DZh y determinar sus relaciones moleculares y evolutivas con otros linajes de B. thailandensis (9).

En conclusión, nuestros hallazgos confirman esto. B. thailandensis Puede causar infecciones graves y los médicos deben ser conscientes de este tipo de infección (10). Por lo tanto, recomendamos encarecidamente fortalecer el seguimiento y seguimiento B. thailandensis Infección tanto en humanos como en ganado.

El Dr. Li es investigador en el Departamento de Medicina de Laboratorio del Hospital Daping de la Universidad Médica Militar de Chongqing, China. Su investigación se centra principalmente en microbiología clínica y enfermedades infecciosas.

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